La Sociedad está integrada por quinientos cincuenta (550) miembros activos distribuidos en un núcleo central con sede en Bogotá D.C., y quince (15) capítulos en todo el país. Los capítulos son:
- Antioquia
- Atlántico
- Bolívar
- Boyacá
- Cesar
- Eje Cafetero
- Guajira
- Huila
- Magdalena
- Magdalena Medio
- Nariño
- Norte de Santander
- Santander del Sur
- Tolima
- Valle
Los Capítulos permiten extender el proceso de integración de los médicos que dedican su labor a la Medicina del Trabajo y la Salud Ocupacional en las diferentes regiones del país y adelantar trabajos conjuntos en el ámbito nacional cuando ello se requiere.