La Sociedad está integrada por quinientos cincuenta (550) miembros activos distribuidos en un núcleo central con sede en Bogotá D.C., y quince (15) capítulos en todo el país. Los capítulos son:

• Antioquia
• Atlántico
• Bolívar
• Boyacá
• Cesar
• Eje Cafetero
• Guajira
• Huila
• Magdalena
• Magdalena Medio
• Nariño
• Norte de Santander
• Santander del Sur
• Tolima
• Valle

Los Capítulos permiten extender el proceso de integración de los médicos que dedican su labor a la  Medicina del Trabajo y la Salud Ocupacional en las diferentes regiones del país y adelantar trabajos conjuntos en el ámbito nacional cuando ello se requiere.